000K  utf8
1100  $c2014
1500  eng
2050  urn:nbn:de:gbv:8-diss-160584
3000  Linke, Klaus Dennis
4000  Method Development for Qualitative, Quantitative and Computational Proteomics$hChristian-Albrechts-Universität zu Kiel  [Linke, Klaus Dennis]
4000  Methodenentwicklung in der Qualitativen, Quantitativen und Computergestützten Proteomforschung$hChristian-Albrechts-Universität zu Kiel  [Linke, Klaus Dennis]
4030  Kiel$nChristian-Albrechts-Universität zu Kiel
4209  Die Protein Phosphorylierung stellt eine wichtige posttranslationale Modifikation dar, die eine Vielzahl biologischer Prozesse reguliert. Um die dynamischen Kontrollmechanismen besser verstehen zu können, ist es wichtig phosphorylierte Proteine identifizieren und quantifizieren zu können. Die Anwendung isobarer Derivatisierungsstrategien (z.B. iTRAQ) zur quantitativen Phosphopeptid-Analyse erfordert (i) optimal eingestellte Peptid-Fragmentierungsbedingungen und (ii) speziell angepasste Algorithmen zur Identifizierung iTRAQ derivatisierter (phosphorylierter) Peptide. Weiterhin (iii) wird eine Vielzahl an Peptide-Spectrum-Matches bzw. Phosphopeptid spezifischer Sequenzen für eine akkurate Quantifizierung benötigt. Diese drei Anforderungen wurden in einer Plattform vereinigt, um iTRAQ derivatisierte (Phospho)Proteine mittels massenspektrometrischer Analyse auf einer LTQ Orbitrap Velos relativ zueinander quantifizieren zu können.
4209  Protein phosphorylation is an important posttranslational modification that plays a regulatory role within numerous biological processes. The simultaneous identification, localization, and quantification of phosphorylated proteins is vital for understanding this dynamic control mechanism. The application of isobaric labeling strategies, e.g., iTRAQ, for quantitative phosphopeptide analysis requires (i) optimal peptide fragmentation conditions, (ii) sophisticated computational proteomics algorithms to identify (phosphorylated) iTRAQ labeled peptides, and (iii) the ability to use more than one Peptide-Spectra-Match and phosphopeptide sequence to guarantee accurate phosphorylation specific quantification. These three demands were combined into a platform to relatively quantify iTRAQ-4Plex labeled (phospho)proteins on a LTQ Orbitrap Velos.
4950  https://nbn-resolving.org/urn:nbn:de:gbv:8-diss-160584$xR$3Volltext$534
4961  https://macau.uni-kiel.de/receive/diss_mods_00016058
5051  540
5550  iTRAQ
5550  iTRAQ
5550  Proteomforschung
5550  proteomics
5550  Quantification
5550  Quantifizierung