Mass Spectrometry based Bioanalytics on Model Organisms

The aim of this work was both the development and application of mass spectrometry (MS) based analytical methods for the investigation of biological research questions on model organisms. The primary focus was on the relative-quantitative proteome analysis by mass spectrometry. A secondary technological aspect of import was the separation of biomolecules by high-performance liquid chromatography (HPLC). The efficient fractionation and separation of complex peptide mixtures form enzymatic full-proteome digests is essential to facilitate a comprehensive mass spectrometric proteome analysis. The combination of HPLC and MS (LC-MS) was applied in the three projects of this thesis.

Das Ziel dieser Arbeit war die Etablierung und Anwendung massenpektrometrischer Analysemethoden zur Untersuchung biologisch relevanter Fragestellungen an Modellorganismen. Im Vordergrund stand dabei die relativ-quantitative Proteomanalyse. Als sekundäre Technologie war die mehrdimensionaler Flüssigkeitschromatographie ein Schwerpunkt der Arbeit. Um eine möglichst umfassende massenspektrometrische Analyse komplexer, aus Vollproteom-Isolaten hergestellter Peptidlösungen zu gewährleisten, ist eine effiziente Fraktionierung und Auftrennung der Probe essentiell. Hochleistungsflüssigkeitschromatographie in Kombination mit Massenspektrometrie (LC-MS) wurde in den drei Teilprojekten dieser These angewandt.

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