Validierung der differentiellen Expression von hnRNPA1, PLEKHA2 und YY1AP1 in Abhängigkeit vom KRAS-Genotyp beim kolorektalen Karzinom

Dreißig bis fünfzig Prozent der kolorektalen Karzinome (KRK) weisen eine KRAS-Mutation auf, welche einen wichtigen prädiktiven und prognostischen Marker darstellt. In dieser Studie wurde die KRAS-abhängige Tumorbiologie von KRKs untersucht.

Dazu wurde das Genexpressionprofil von KRAS-MUT mit KRAS-WT Tumoren verglichen. Nachfolgende Validierungsstudien untersuchten auf translationaler Ebene die tumorbiologische Bedeutung einer Auswahl differentiell exprimierter Gene. Die differentielle Expression wurde zunächst mit Gene arrays und quantitativer real-time Polymerase-Kettenreaktion anhand acht KRAS-mutierter und acht KRAS-Wildtyp KRKs untersucht. Es folgte die immunhistochemische Färbung eines Studienkollektivs von insgesamt 1786 KRK-Fällen anhand von Großflächenschnitten und tissue micro arrays (TMAs). 48 Genes zeigten in den Gene arrays eine bimodale, transkriptionelle Expression zwischen KRAS-MUT und KRAS-WT KRKs. Mit Hilfe einer Literaturrecherche wurden hnRNPA1, PLEKHA2 und YY1AP1 für weitere Validierungsstudien ausgewählt.

Mittels Immunohistochemie konnten hnRNPA1, PLEKHA2 und YY1AP1 in verschiedenen zellulären Kompartimenten wie dem Zellkern, dem Zytoplasma und der Plasmamembran von KRKs nachgewiesen werden. Die hnRNPA1-Expression korrelierte mit dem KRAS-Genotyp, der Tumorlokalisation, dem T- und dem UICC-Stadium. PLEKHA2 korrelierte mit der Tumorlokalisation, dem lokalen Tumorwachstum, der Lymphgefäßinvasion, dem Alter, dem Tumorstadium und dem Grading.

Eine univariate Überlebensanalyse wies ein reduziertes Fünf-Jahres-Überleben für hnRNPA1- und ein besseres Überleben für PLEKHA2-positive KRKs nach. Interessanterweise war hnRNPA1 ein unabhängiger Prognosemarker für das Patientenüberleben.

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