Etablierung eines NGS-basierten Verfahrens zur Bestimmung minimaler Resterkrankung bei B-Zell-Lymphomen anhand zellfreier DNA

Bei Follikulären Lymphomen ist die Bestimmung der minimalen Resterkrankung (MRD) im Therapieverlauf ein wesentlicher prognostischer Faktor. Allerdings sind der bisher angewandten Standardmethode der RQ-PCR zum Nachweis einer tumorspezifischen Rekombination des Immunglobulinschwerkettengens Limitationen gesetzt. Neben der arbeitsaufwändigen Etablierung patientenspezifischer Assays bleibt die RQ-PCR eine relative Quantifizierungsmethode mit einer begrenzten Sensitivität.

Zellfreie DNA beschreibt kurze DNA Fragmente von 160-180 Basenpaaren, die von gesunden Zellen und von Tumorzellen in den Blutstrom freigesetzt und aus Plasma isoliert werden können. Sie stellt eine potenzielle alternative Quelle für die Bestimmung von molekularen Veränderungen des Tumors und minimaler Resterkrankung dar. 

In dieser Arbeit wurden standardisierte Verfahrensweisen zur Handhabung der zellfreien DNA für die MRD Diagnostik etabliert, die als Grundlage für eine prospektive  MRD-Bestimmung im Plasma im Rahmen zukünftiger Studien dienen können. 

Der hohe Stellenwert einer NGS-basierten MRD-Diagnostik für die Analyse von zellfreier DNA in Follikulären Lymphomen konnte in dieser Arbeit belegt und die Anwendbarkeit durch ein standardisiertes Vorgehen verbessert werden.

Neben der RQ-PCR und der hier als gleichwertig belegten ddPCR kann die zellfreie DNA zuverlässig und hochsensitiv mit NGS-basierten Assays untersucht werden. Dies bietet die Möglichkeit, die MRD Diagnostik im Plasma in zukünftigen Studien auch prospektiv in größeren Patientenkollektiven anzuwenden. 

 

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