Untersuchung des Einflusses von APOE Isoformen auf die Proteome von Geweben und Zellen

In der vorliegenden Arbeit wurden Proteomik Analysen basierend auf Flüssigchromatographie-Massenspektrometrie (LC-MS) zur Untersuchung der Effekte der Isoformen Apolipoprotein E3 (APOE3) bzw. E4 (APOE4) in Leber-, Niere- sowie Cortexgewebe von Targeted Replacement (TR) Mäusen und in kultivierten Huh7-Zellen verwendet. Diese Arbeit umfasste die quantitativen Bottom-Up-MS Analysen von Geweben von APOE3 bzw. APOE4 TR Mäusen, welche unterschiedlichen Zugang zu einer fett- und zuckerreichen Ernährung erhielten. Weitergehend wurden N-Terminomik Strategien zur Identifizierung von nativen und neo-N-Termini in Lebergeweben von APOE3 und APOE4 TR Mäusen angewendet. Abschließend wurden durch Bottom-Up und Middle-Down-Methoden potentielle APOE Interaktionspartner in co-immunpräzipitierten APOE3 und APOE4 transfizierten Huh7-Zellen identifiziert.