Characterization of the intratumor microbiome in pancreatic cancer patients and infection models

Diese Dissertation untersucht das intratumorale Mikrobiom beim duktalen Pankreasadenokarzinom (PDAC). Zunächst wird die Rationale für die Mikrobiomanalyse dargelegt: Klinische und immunhistochemische Parameter allein konnten die unterschiedlichen Überlebenszeiten einer gut charakterisierten Patient:innenkohorte nicht erklären. Das intratumorale Mikrobiom hingegen ist mit dem patient:innenüberleben assoziiert: Mithilfe von 16S rRNA Sequenzierung werden bakterielle Taxa identifiziert, welche mit dem Überleben korrelierten. Weiterhin wird die Lokalisation und Assoziation der Bakterien im Gewebe charakterisiert. Der zweite Teil widmet sich funktionellen in vitro Infektionsstudien, die untersuchen, wie ausgewählte Bakterien Zellsignalgebung, Inflammation und Immunzellverhalten beeinflussen. Die Arbeit schließt mit einer Diskussion des prognostischen Werts des Mikrobioms und seines therapeutischen Potenzials im PDAC.

This dissertation investigates the intratumor microbiome in pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC). It outlines the rationale for microbiome analysis: clinical and immunohistochemical parameters alone could not account for the divergent survival of a well-characterized patient cohort. However, the intratumor microbiome could; 16S rRNA sequencing analysis identifies bacterial taxa linked to survival. Additionally, their spatial localization and association to different cells within the tissues were characterized. Secondly, functional in vitro infection experiments explore how selected bacteria affect pancreatic cell signaling, inflammation, and immune cell behavior. The thesis concludes with a discussion of the microbiome's prognostic value and its potential as a future therapeutic target in PDAC.

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